Die Suche nach dem Mörder ihres Vaters führt die Schülerin Ryuuko, Trägerin eines scherenförmigen Schwerts, zur Honnouji Akademie, die unter dem gnadenlosen Regime der Schulsprecherin Satsuki steht. Um die Wahrheit zu erfahren, muss sie es mit Eliteschülern aufnehmen, deren spezielle Schuluniformen…mehr anzeigen
Ryuko wird mit dem „No-Late-Day“ konfrontiert, einem Ereignis, bei dem die Schüler einen mit Fallen gespickten Hindernisparcours überwinden müssen, um rechtzeitig in der Schule zu sein, sonst werden sie von der Schule verwiesen.